Fix shebang for the perl scripts

Last-Update: 2020-11-08

Gbp-Pq: Name 60_fix_path_perl.patch

Fix path for the installation of python modules

Last-Update: 2020-11-06

Gbp-Pq: Name 50_fix_python-modules_path.patch

Drop medical examples

Last-Update: 2020-10-21

Gbp-Pq: Name 30_drop_medical_example.patch

Do not try linking with -lsocket

Gbp-Pq: Name 20_do_not_link_against_socket.patch

_matplotlib

===================================================================

Gbp-Pq: Name 10_matplotlib.patch

Update changelog.

fix_xmlwriter_ascii_implicit_cellarray_segfault.patch: write the cell types

Guarding the null iterator only removed the crash, the array was still
written empty. Write arrays without an iterator through an explicit copy
and let the autopkgtest read the file back to check the cell count.

Update changelog.

upload 9.6.2+dfsg1-2 to unstable

transition #1141369

upload 9.6.2+dfsg1-1exp5 to experimental

Revert "(Build-)Depends: tao-pegtl-dev to support external PEGTL (tao)"

This reverts commit 40a6ef7735852b03253692722eeb812e3e8b6ef2.

tao-pegtl-dev 3.2.7 is not compatible with vtk 9.6.

There was MR !11999 to update VTK, but it has been abandoned,
and does not merge cleanly into current source.
https://gitlab.kitware.com/vtk/vtk/-/merge_requests/11999

See also
https://gitlab.kitware.com/vtk/vtk/-/work_items/17876
https://gitlab.kitware.com/vtk/vtk/-/work_items/18151

Cannot close Bug#1035426 until upstream sorts out their pegtl support.

fix contents of debian/python3-vtk9.pydist

see man page for dh_python3
and /usr/share/doc/dh-python/README.PyDist

install vtkQImageToImageSource.h and vtkQWidget*.h to libqt9-qt-dev

not libqt9-dev

Together with the preceding tao-pegtl-dev patch,

Closes: #1035426

(Build-)Depends: tao-pegtl-dev to support external PEGTL (tao)

with -DVTK_MODULE_USE_EXTERNAL_VTK_pegtl=ON

see Bug#1035426

add debian patch build_reproducibility.patch to remove XDMF_SYSTEM

this patch maintains build reproducibility by dropping XDMF_SYSTEM
from XdmfConfig.h in xdmf2 headers.

XDMF_SYSTEM is set to CMAKE_SYSTEM, including the Linux version at
build time. It is not actually used by the code.

Closes: #1120818

upload 9.6.2+dfsg1-1exp4 to experimental

run manual dh_install to install viskores.pc before deleting excess files

otherwise Qt files (intended for libvtk9-qt-dev) get reinstalled into
libvtk9-dev

upload 9.6.2+dfsg1-1exp3 to experimental

list viskores.pc in debian/not-installed

to work around Bug#972222 in debhelper.

viskores.pc is not built on 32-bit systems
and so is installed conditionally to libvtk9-dev in debian/rules.

This non-installed entry is needed for arch-independent builds
because of Bug#972222

upload 9.6.2+dfsg1-1exp2 to experimental

debian/tests: #include <iostream> in tests using std::cout

install viskores.pc to libvtk9-dev conditionally

viskores does not build on 32-bit arches

upload 9.6.2+dfsg1-1exp1 to experimental

fix libvtk9-dev Depends: libmariadb-dev not libmariadbclient-dev

libvtk9.6-qt: drop redundant Breaks: Provides: Replaces: libvtk9.1-qt

new source replaces ThirdParty/h5part with ThirdParty/h5hut

still licensed with BSD-3-clause-notice-2

configure support for SQL

Activate SQL support by configuring modules
IO::SQL and IO::MySQL.

Interface with QtSQL with
GUISupportQtSQL=YES

Configure IO::PostgreSQL module to activate PostgreSQL support

provides viskores.c and vtkWrapJavaScript-9.6

pkgconfig file for viskores (in libvtk9-dev)

vtkWrapJavaScript-9.6 executable (in vtk9 package)

update packages for new ABI 9.6

drop patch version from name of manpages (keep as 9.6, not 9.6.2)

Build-Depends: libmariadb-dev not libmariadbclient-dev

refresh patches

drop debian patches applied upstream

40_viskores.patch
findEXPAT_version_fix_MR12826.patch
numpy_drop_in1d_MR12693.patch

use external exprtk

-DVTK_MODULE_USE_EXTERNAL_VTK_exprtk:BOOL=ON

Build-Depends: libexprtk-dev

debian/copyright: Files-Excluded: ThirdParty/exprtk/vtkexprtk

Closes: #1094438

Build-Depends: libpq-dev to activate PostgreSQL support

Depends: libmariadbclient-dev rather than default-libmysqlclient-dev

mariaDB has sufficiently evolved from mySQL to stop claiming
compatibility.

Note that VTK9 nevertheless still treats mariaDB as a substitute for
mySQL.

Closes: #1137152

provide debian/python3-vtk9.pydist

to declare python3-vtk9 as python package vtk.

Closes: #1096135

mark new upstream release in changelog

Update upstream source from tag 'upstream/9.6.2+dfsg1'

Update to upstream version '9.6.2+dfsg1'
with Debian dir 1031a337ad953b622f341da99d0a36fba5c43a5f

New upstream version 9.6.2+dfsg1

Merge branch 'master' into experimental

upload 9.5.2+dfsg4-5 to unstable

Standards-Version: 4.7.4

add debian patch numpy_drop_in1d_MR12693.patch

applies upstream MR#12693 to remove numpy.in1d, no longer provided by
numpy 1.24 (use numpy.isin instead).

Closes: #1137015

upload 9.5.2+dfsg4-4 to unstable

add debian patch gdal-3.13.patch

enables build with gdal 3.13.
Thanks Bas Couwenberg.

Closes: #1134162

mark libvtk9-dev as Multi-Arch: no, not Multi-Arch: same

since some header files contain arch-dependent definitions
(vtkOptions.h, vtkEndian.h, cgnstypes.h, XdmfConfig.h
setting endianness, int size, etc).

Consequently drop Multi-Arch: same from libvtk9-qt-dev
to avoid including inconsistent header definitions

Closes: #1133759

Update changelog.

Relax upstream boost version in substvars. (Closes: #1130578)

Update changelog.

Remove Priority and RRR fields

Add versioned libboost-dev dependency. (Closes: #1129768, #1129770, #1129773)

Record the exact Boost version used at build time to ensure
compatibility and trigger rebuilds on upgrades.

Upload 9.5.2+dfsg4-1 to unstable

Motivate repack

Update upstream source from tag 'upstream/9.5.2+dfsg4'

Update to upstream version '9.5.2+dfsg4'
with Debian dir 4ce61fe49ee3594ddf351160faa161f858ad009b

New upstream version 9.5.2+dfsg4

  * Add back WebCore, WebGLExporter and WebPython modules for future use
    within trame and pyvista.

upload 9.5.2+dfsg3-8 to unstable

sh4: override dh_dwz to not process libvtkCommonCore

it fails with "Cannot allocate memory"

upload 9.5.2+dfsg3-7 to unstable

update debian/watch to v5 format with GitLab template

Use GitLab template rather than GitHub since upstream development
happens at https://gitlab.kitware.com/vtk/vtk

https://github.com/Kitware/VTK is just a mirror of the gitlab repo.

add hurd-amd64 to list of architectures supporting adios2

in Build-Depends: libadios2-mpi-c++-dev

adios2 now builds on all 64-bit architectures
supported by Debian

upload 9.5.2+dfsg3-6 to unstable

add alpha to list of ADIOS2-supporting arches

in Build-Depends: libadios2-mpi-c++-dev

add debian patch matplotlib_nullptr_s390x.patch

handles case of null ScalarPointer in image in
vtkMatplotlibMathTextUtilities::RenderOneCell

A null pointer was generated on s390x causing pyvista
test_add_text_latex to segfault.

See upstream #19931
https://gitlab.kitware.com/vtk/vtk/-/issues/19931

Closes: #1126861

upload 9.5.2+dfsg3-5 to unstable

disable viskores on alpha

alpha is 64-bit but also exceeds available memory

[  5%] Generating the wrap hierarchy for VTK::ImagingCore
cd /build/reproducible-path/vtk9-9.5.2+dfsg3/debian/build/Imaging/Core && ../../bin/vtkWrapHierarchy-9.5 -MF /build/reproducible-path/vtk9-9.5.2+dfsg3/debian/build/Imaging/Core/CMakeFiles/vtkImagingCore-hierarchy.txt.d @/build/reproducible-path/vtk9-9.5.2+dfsg3/debian/build/Imaging/Core/CMakeFiles/vtkImagingCore-hierarchy.None.args -o /build/reproducible-path/vtk9-9.5.2+dfsg3/debian/build/lib/alpha-linux-gnu/vtk-9.5/hierarchy/VTK/vtkImagingCore-hierarchy.txt /build/reproducible-path/vtk9-9.5.2+dfsg3/debian/build/Imaging/Core/CMakeFiles/vtkImagingCore-hierarchy.data @/build/reproducible-path/vtk9-9.5.2+dfsg3/debian/build/Imaging/Core/CMakeFiles/vtkImagingCore-hierarchy.depends.args
/usr/bin/alpha-linux-gnu-ld.bfd: CMakeFiles/viskores_cont.dir/UnknownArrayHandle.cxx.o: .got subsegment exceeds 64K (size 96168)
/usr/bin/alpha-linux-gnu-ld.bfd: failed to set dynamic section sizes: no error

document that 9.5.2+dfsg3-3 disabled viskores on 32-bit arches

hadn't been added to changelog in commit
e10222dfcf4141437dcc36fa9a54e411e4b9f0a5

refresh patches

add debian patch findEXPAT_version_fix_MR12826.patch

applies upstream MR#12826 to fix expat version handling

Closes: #1050506

upload 9.5.2+dfsg3-4 to unstable

debian/rules: use UPSTREAM_VERSION_ABI to refer to version specific library

Currently 9.5, defining package libvtk9.5.

Needed to fix handling of Qt modules
(don't delete Qt files from qt component packages)

upload 9.5.2+dfsg3-3 to unstable

disable viskores on 32-bit arches

ParaView::RemotingViews optionally uses VTK::vtkviskores
but (ThirdParty) viskores exhausts virtual memory on 32-bit architectures

remove version-specific references from debian/rules

build docs in arch-indepedent build only

upload 9.5.2+dfsg3-2 to unstable

escape sequences in vtkMethodParser.py are fixed
Closes: #1079541

enable RenderingFreeTypeFontConfig

Closes: #1101916

build docs in arch-independent build only

Move doc generating packages doxygen-latex, ghostscript,
gnuplot-nox, graphviz to Build-Depends-Indep <!nodoc>

Closes: #1125140

Standards-Version: 4.7.3

don't configure xdmf3 (i.e. IOParallelXdmf3) on 32-bit arches

where vtk's copy of xdmf3 fails to build. See Bug#1126484
upstream paraview Issue #22630
https://gitlab.kitware.com/paraview/paraview/-/issues/22630

Configuration of VTK::xdmf3 as an external library (libxdmf-dev builds
for all architectures) might resolve it, help welcome.

extra VTK modules support paraview. Closes: #1100766

upload 9.5.2+dfsg3-1 to unstable

Build-Depends: libxcursor-dev (enables custom cursors)

set HDF5_PREFER_PARALLEL=YES (with HDF5_IS_PARALLEL=ON)

to activate parallel HDF5 (via libhdf5-mpi-dev)

Build-Depends: libhdf5-mpi-dev was already in place
but needs HDF5_PREFER_PARALLEL=YES since otherwise serial HDF5 is used
by default

add support for IOADIOS2 (used by paraview)

64-bit arches only

Build-Depends: libadios2-mpi-c++-dev [amd64 arm64 mips64el ppc64el
  riscv64 s390x loong64 ppc64 sparc64]

drop VTK Web modules

Web is for supporting VTK use in web browsers.

paraview can get by without it (PARAVIEW_ENABLE_WEB=OFF)

bump repacked version to dfsg3 to add xdmf3

Update upstream source from tag 'upstream/9.5.2+dfsg3'

Update to upstream version '9.5.2+dfsg3'
with Debian dir 5f1d72ab770197761da357e4232e8e061ac64ec8

New upstream version 9.5.2+dfsg3

enable ThirdParty/xdmf3

drop from Files-Excluded in debian/copyright

Needed by IO[Parallel]Xdmf3

enable modules required by paraview 6

use IOParallelXdmf3 for IOXdmf3

Enable VTK external rendering with SDL, GLFW, etc.

Fix vtk9-doc FTBFS

debian/rules cleanup

simplify deletion

install updated manpages

remove unused libvtk9-doc.doc file

Rename manpages to include section suffix .1

upload to unstable

install updated manpages

update man pages